Esta ansökan (genomresa)

Nej.

Vad händer om jag har ansökt ja på den frågan?

Ganska säkert ingenting.
Gör man t.ex flera resor så blir det ju ändå ofta fel uppgift, anger man genomresa först så får man ha uppgiften på kommande resor även om man då stannar i landet. Uppgiften går inte att uppdatera inför kommande resor.

Helt säker på att en förklaring av den aktuella resan och eventuellt att man missförstått frågan, i gränskontrollen räcker.